目的:联合多种生物信息学分析方法筛选多发性硬化症(multiple sclerosis,MS)与肌萎缩侧索硬化症(amyotrophic lateral sclerosis,ALS)之间的枢纽基因,从遗传学角度探索以上两种疾病的潜在联系并辅以诊断、治疗。方法:利用GEO数据库筛选基因表达数据集,利用R软件中的Limma包筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对差异基因进行GO术语分析、KEGG通路分析、蛋白相互作用网络分析(protein-protein interaction,PPI)、ROC分析以及qRT-PCR分析等。结果:共纳入2个GEO数据集(GSE108000和GSE68605),与正常组相比,MS存在681个DEGs,ALS存在1365个DEGs,MS与ALS之间存在66个共同DEGs,其中前10个枢纽基因被证明与MS和ALS存在密切联系。此外,为更好的辅以临床诊断与治疗,本研究使用Enrichr平台检测前10个枢纽基因的标志性药物分子。同时根据ROC分析,以及qRT-PCR分析确定前四个枢纽基因的诊断效能。结论:通过生物信息学方法有效地筛选出MS和ALS间的枢纽基因,为开发临床诊断与治疗靶点提供新思路。